纱

DOI:10.18129 / B9.bioc.yarn

纱:健壮Multi-Condition RNA-Seq预处理和标准化

Bioconductor版本:版本(3.13)

加快大型RNA-Seq分析使用以前开发的组合工具。纱是为了方便用户在执行基本mis-annotation质量控制、过滤和condition-aware正常化。纱利用许多Bioconductor工具和统计技术占大型异构性和稀疏很大RNA-seq实验。

作者:约瑟夫·N保尔森(aut (cre) Cho-Yi陈(aut),卡米拉Lopes-Ramos (aut) Marieke Kuijjer (aut),约翰Platig (aut) Abhijeet Sonawane (aut),莫德Fagny (aut),金伯利玻璃(aut),约翰Quackenbush (aut)

维护人员:约瑟夫·保尔森N <保尔森。约瑟夫在gene.com >

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如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“纱线”)

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browseVignettes(“纱线”)

PDF	R脚本	纱:健壮Multi-Tissue RNA-Seq预处理和标准化
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细节

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版本	1.18.0
Bioconductor自	BioC 3.4 (r - 3.3)(4.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	Biobase
进口	biomaRt,下载器,刨边机,gplots、图形、limma,matrixStats,preprocessCore,readr,RColorBrewer统计数据,quantro
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建议	knitr,rmarkdown,testthat(> = 0.8)
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包档案

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源包	yarn_1.18.0.tar.gz
Windows二进制	yarn_1.18.0.zip(32位和64位)
macOS 10.13(高山脉)	yarn_1.18.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/yarn
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/纱
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/yarn/
包下载报告	下载数据