Bioconductor版本:Release (3.16)
Well-Plate Maker (WPM)是一个作为R包部署的闪亮应用程序。命令行/脚本使用的函数也可用。WPM允许用户生成井板图来进行实验,同时改进批处理效果。特别是,由于它能够在多个孔板上随机分配样本,因此有助于控制“板效应”。放置样本的算法受到回溯算法的启发:在尊重特定空间约束的情况下,随机放置样本。
作者:海伦·博尔赫斯[aut, cre],托马斯·伯格[aut]
维护者:Helene Borges < Borges . Helene。Sophie在gmail.com>
引文(从R内,输入引用(wpm)
):
要安装这个包,启动R(版本"4.2")并输入:
如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("wpm")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放。
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes (wpm)
超文本标记语言 | R脚本 | 如何使用Well制版机 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 |
版本 | 1.8.0 |
在Bioconductor | BioC 3.12 (R-4.0)(2年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R (>= 4.1.0) |
进口 | 跑龙套、方法cli,Biobase,SummarizedExperiment,配置,傀儡,闪亮的,DT,ggplot2,dplyr,rlang,stringr,shinydashboard,shinyWidgets,shinycustomloader,RColorBrewer,日志记录 |
链接 | |
建议 | MSnbase,testthat,BiocStyle,knitr,rmarkdown |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/HelBor/wpm//www.anjoumacpherson.com/packages/release/bioc/html/wpm.html |
BugReports | https://github.com/HelBor/wpm/issues |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | wpm_1.8.0.tar.gz |
Windows二进制 | wpm_1.8.0.zip |
macOS二进制文件(x86_64) | wpm_1.8.0.tgz |
macOS二进制文件(arm64) | wpm_1.8.0.tgz |
源库 | Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/wpm |
源存储库(开发人员访问) | Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/wpm |
Bioc软件包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/wpm/ |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/wpm/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |