生物导体版本:版本(3.15)
可视化测序实验的读取覆盖范围以及基因组注释(基因,转录本,峰)的工具。长转录本的内含子可以重新缩放至固定长度,以更好地可视化外显子读覆盖范围。
作者:Kaur Alasoo [AUT,CRE]
维护者:gmail.com上的Kaur Alasoo
引用(从r内,输入引用(“ WigglePlotr”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:
if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)Biocmanager :: install(“ WigglePlotr”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“ wiggleplotr”)
html | R脚本 | WigglePlotr简介 |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
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版本 | 1.20.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.5(R-3.4)(5年) |
执照 | Apache许可证2.0 |
要看 | R(> = 3.6) |
进口 | dplyr,,,,GGPLOT2(> = 2.2.0),基因组机,,,,rtracklayer,,,,牛仔图,,,,断言,,,,purrr,,,,S4VECTORS,,,,iranges,,,,GenomeInfodB |
链接 | |
建议 | 尼特,,,,rmarkDown,,,,Biomart,,,,GenomicFeatures,,,,测试,,,,Ensembldb,,,,ensdb.hsapiens.v86,,,,org.hs.eg.db,,,,txdb.hsapiens.ucsc.hg38.nown,,,,AnnotationDbi,,,,AnnotationFilter |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | wigglePlotr_1.20.0.tar.gz |
Windows二进制 | wigglePlotr_1.20.0.zip |
MacOS 10.13(高山脉) | wigglePlotr_1.20.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/wiggleplotr |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/wiggleplotr |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/wiggleplotr/ |
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