Universalmotif
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doi：10.18129/b9.bioc.universalmotif
用R导入，修改和导出图案
生物导体版本：版本（3.13）
允许将大多数常见的基序类型导入R，以通过其他生物导体相关软件包提供的功能使用。可以将基序导出为来自其他生物导体包装定义的各种类别的大多数主要基序格式。包括一个基序和序列操纵和分析函数的套件，包括富集，比较，p值计算，改组，修剪，高阶基序等。
作者：本杰明·让·玛丽·特雷伯（Benjamin Jean-Marie Tremblay）[AUT，CRE]
，Spencer Nystrom [CTB]
维护者：本杰明·让·玛丽·特雷布莱（Benjamin Jean-Marie Tremblay）
引用（从r内，输入引用（“ Universalmotif”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.1”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ UniversalMotif”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
Browsevignettes（“ Universalmotif”）
| R脚本 | “ Universalmotif”简介 | |
| R脚本 | 序列主题简介 | |
| R脚本 | 主题比较和p值 | |
| R脚本 | 图案进口，出口和操纵 | |
| R脚本 | 序列操纵和扫描 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.10.1 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.8（R-3.5）（2。5年） |
| 执照 | GPL-3 |
| 要看 | R（> = 3.5.0） |
| 进口 | 方法，统计，utils，大量的，，，，GGPLOT2，，，，Yaml，，，，iranges，，，，RCPP，，，，生物弦，，，，生物基因，，，，S4VECTORS，，，，rlang， 网格 |
| 链接 | RCPP，，，，rcppthread |
| 建议 | 拼写，，，，尼特，，，，预订，，，，TFBSTOOLS，，，，rmarkDown，，，，主题，，，，测试，，，，生物比较，，，，seqlogo，，，，Motifstack，，，，dplyr，，，，猿，，，，格特里，，，，processx，，，，ggseqlogo，，，，牛仔图，，，，基因组机，，，，GGBIO |
| 系统要求 | |
| 增强 | pwmenrich，，，，rgadem |
| URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/universalmotif/ |
| BugReports | https://github.com/bjmt/universalmotif/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | Circrnaprofiler，，，，模因 |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | Universalmotif_1.10.1.tar.gz |
| Windows二进制 | Universalmotif_1.10.1.zip |
| MacOS 10.13（高山脉） | Universalmotif_1.10.1.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/universalmotif |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/universalmotif |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/universalmotif/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
| Bioc 3.13的旧源软件包 | 来源存档 |
