tximeta
 |
 |
 |
 |
 |
 |
 |
doi：10.18129/b9.bioc.tximeta
用自动元数据导入的成绩单定量
生物导体版本：版本（3.13）
转录定量从鲑鱼和Alevin进口，并自动连接转录本范围和释放信息，以及其他相关的元数据。从头转录组可以链接到具有LinkedTxomes的适当来源，并共享用于计算可重复性。
作者：Michael Love [Aut，Cre]，Charlotte Soneson [AUT，CTB]，Peter Hickey [Aut，CTB]，Rob Patro [AUT，CTB]，NIH NHGRI [FND]，CZI [FND]
维护者：迈克尔·洛夫（Michael Love）
引用（从r内，输入引用（“ tximeta”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.1”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ tximeta”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
browsevignettes（“ tximeta”）
| html | R脚本 | 用自动元数据导入的成绩单定量 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.10.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.8（R-3.5）（2。5年） |
| 执照 | GPL-2 |
| 要看 | |
| 进口 | 总结性特征，，，，tximport，，，，jsonlite，，，，S4VECTORS，，，，iranges，，，，基因组机，，，，AnnotationDbi，，，，GenomicFeatures，，，，Ensembldb，，，，Biocfilecache，，，，AnnotationHub，，，，生物弦，，，，蒂布尔，，，，GenomeInfodB，工具，utils，方法，矩阵 |
| 链接 | |
| 建议 | 尼特，，，，rmarkDown，，，，测试，，，，tximportdata，，，，org.dm.eg.db，，，，deseq2，，，，EDGER，，，，林玛，，，，DevTools |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | https://github.com/mikelove/tximeta |
| 取决于我 | rnaseqgene |
| 进口我 | 同工型间分析仪 |
| 建议我 | deseq2，，，，鱼池，，，，氟化物学 |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | tximeta_1.10.0.tar.gz |
| Windows二进制 | tximeta_1.10.0.zip |
| MacOS 10.13（高山脉） | tximeta_1.10.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/tximeta |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/tximeta |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/tximeta/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
