三元
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doi：10.18129/b9.bioc.triplex
在DNA中搜索和可视化分子内三形形成序列
生物导体版本：版本（3.15）
该软件包提供了用于识别和可视化DNA序列中潜在分子内三形模式的功能。主要功能是检测能够以更大的序列折叠成分子内三分（H-DNA）的子序列的位置。电势H-DNA（三）应由尽可能多的炮核苷酸三重态制成。该软件包包括可视化，显示1D，2D或3D中的确切基本配对。
作者：Jiri Hon，Matej Lexa，Tomas Martinek和Kamil Rajdl的贡献
维护者：jiri hon
引用（从r内，输入引用（“三重”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：
if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）Biocmanager :: install（“ triplex”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
Browsevignettes（“ Triplex”）
| R脚本 | Triplex用户指南 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 | |
| 文本 | 执照 |
细节
| 生物浏览 | bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.36.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 2.12（R-3.0）（9。5年） |
| 执照 | bsd_2_clause +文件执照 |
| 要看 | r（> = 2.15.0），S4VECTORS（> = 0.5.14），iranges（> = 2.5.27），xvector（> = 0.11.6），生物弦（> = 2.39.10） |
| 进口 | 方法，网格，基因组机 |
| 链接 | S4VECTORS，，，，iranges，，，，xvector，，，，生物弦 |
| 建议 | RGL（> = 0.93.932），bsgenome.celegans.ucsc.ce10，，，，rtracklayer |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | http://www.fi.muni.cz/~lexa/triplex/ |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | triplex_1.36.0.tar.gz |
| Windows二进制 | triplex_1.36.0.zip（仅64位） |
| MacOS 10.13（高山脉） | Triplex_1.36.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/triplex |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：包装/三 |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/triplex/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
