三人组

DOI:10.18129 / B9.bioc.trio

检测单核苷酸多态性和SNP交互Case-Parent三人研究

Bioconductor版本:版本(3.16)

检测单核苷酸多态性和SNP基因型的交互的TDT。这个包此外包含函数计算成对值LD措施和确定LD街区,以及功能设置匹配情况下pseudo-control基因型数据case-parent三人小组为了运行三个逻辑回归,在三人小组将缺失的基因型,为模拟case-parent三人小组与疾病风险依赖SNP交互,对权力和样本量计算三个数据。

作者:Holger Schwender清丽,菲利普·伯杰,玛格丽特•陶布Christoph Neumann Ingo Ruczinski

维护人员:Holger Schwender < Holger。等在gmx.de >

从内部引用(R,回车引用(“三”)):

安装

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如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“三”)

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文档

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browseVignettes(“三”)

PDF R脚本 三个逻辑回归和基因型的TDT
PDF 参考手册

细节

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版本 3.36.0
Bioconductor自 BioC 2.13 (r - 3.0)(9.5年)
许可证 LGPL-2
取决于 R (> = 3.0.1)
进口 grDevices、图形方法、统计数据生存跑龙套,siggenes,LogicReg(> = 1.6.1)
链接
建议 haplo.stats,mcbiopi样条函数,logicFS(> = 1.28.1),KernSmooth,VariantAnnotation
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包档案

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源包 trio_3.36.0.tar.gz
Windows二进制 trio_3.36.0.zip(64位)
macOS二进制(x86_64) trio_3.36.0.tgz
macOS二进制(arm64) trio_3.36.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/trio
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/三人
Bioc包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/trio/
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/trio/
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