扳机

doi:10.18129/b9.bioc.trigger

转录调节基因表达遗传学的推断

生物导体版本:版本(3.15)

该R软件包为整合基因组数据提供了统计分析的工具,该数据涉及以下组合:基因型,高维中间性状(例如,基因表达,蛋白质丰度)和高阶性状(表型)。该软件包包括以下功能:(1)在遗传标记和基因表达之间构造全局链接图;(2)分析多基因链接(epipitasis)的基因表达;(3)量化每个基因座解释的全基因组变异的比例,并识别EQTL热点;(4)估计成对的因果基因调节概率并构建基因调节网络;(5)确定因果基因的定量特征。

作者:Lin S. Chen ,Dipen P. Sangurdekar 和John D. Storey

维护者:John D. Storey 的Jstorey>

引用(从r内,输入引用(“触发”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)Biocmanager :: install(“触发”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“触发”)

PDF R脚本 触发教程
PDF 参考手册
文本 消息

细节

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版本 1.42.0
在生物导体中 Bioc 2.9(R-2.14)(10。5年)
执照 GPL-3
要看 r(> = 2.14.0),公司,,,,QTL
进口 QVALUE,方法,图形,SVA
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源包 trigger_1.42.0.tar.gz
Windows二进制 trigger_1.42.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) trigger_1.42.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/trigger
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/触发器
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/trigger/
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