三轮车
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doi：10.18129/b9.bioc.tricycle
三轮车：可转移表示和细胞周期的推断
生物导体版本：版本（3.13）
该软件包包含使用单细胞RNASEQ数据推断和可视化细胞周期过程的函数。它利用了转移学习的想法，将新数据投射到先前的学习生物学上可解释的空间。我们提供了预学的细胞周期空间，可用于推断人类和小鼠单细胞样品的细胞周期时间。此外，我们还提供功能来可视化不同嵌入和功能上的细胞周期时间以构建新参考。
作者：Shijie Zheng [AUT，CRE]
维护者：shijie Zheng
引用（从r内，输入引用（“三轮车”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.1”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“三轮车”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
Browsevignettes（“三轮车”）
| html | R脚本 | 三轮车：可转移表示和细胞周期的推断 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.0.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.13（R-4.1）（<6个月） |
| 执照 | GPL-3 |
| 要看 | r（> = 4.1），Singlecellexperiment |
| 进口 | 方法，圆，，，，GGPLOT2，，，，AnnotationDbi，，，，评分，，，，基因组机，，，，iranges，，，，S4VECTORS，，，，散点，，，，dplyr，，，，rcolorbrewer，grdevices，统计，总结性特征，UTILS |
| 链接 | |
| 建议 | 测试（> = 3.0.0），生物使用，，，，尼特，，，，rmarkDown，，，，Circstats，，，，牛仔图，，，，htmltools，，，，Seurat，，，，org.hs.eg.db，，，，org.mm.eg.db |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | https://github.com/hansenlab/tricycle |
| BugReports | https://github.com/hansenlab/tricycle/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | tricycle_1.0.0.0.tar.gz |
| Windows二进制 | tricycle_1.0.0.0.zip |
| MacOS 10.13（高山脉） | tricycle_1.0.0.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/tricycle |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：包装/三轮车 |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/tricycle/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
