树
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doi：10.18129/b9.bioc.treeio
系统发育树的输入和输出的基础类别和功能
生物导体版本：版本（3.15）
“ Treeio”是一个R软件包，可以使使用相关数据更容易导入和存储系统发育树；并将不同来源的外部数据与系统发育联系起来。它还支持将系统发育树用异质的相关数据导出到单个树文件中，并且可以用作将树与关联数据和转换文件格式合并的平台。
作者：广琴Yu [AUT，CRE]
，Tommy Tsan-Yuk Lam [CTB，THS]，Shuangbin Xu [CTB]，Bradley Jones [CTB]，Casey Dunn [CTB]，Tyler Bradley [CTB]，Konstantinos Geles [CTB]
维护者：gmail.com> guangchuang yu
引用（从r内，输入引用（“ Treeio”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：
if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）Biocmanager :: install（“ Treeio”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
Browsevignettes（“ Treeio”）
| html | R脚本 | 树 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.20.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.5（R-3.4）（5年） |
| 执照 | 艺术2.0 |
| 要看 | R（> = 3.6.0） |
| 进口 | 猿，，，，dplyr，，，，jsonlite，，，，马格里特， 方法，rlang，，，，蒂布尔，，，，tidytree（> = 0.3.9），UTILS |
| 链接 | |
| 建议 | 生物弦，，，，GGPLOT2，，，，格特里，，，，Igraph，，，，尼特，，，，rmarkDown，，，，Phangorn，，，，Prettydoc，，，，测试，，，，花花公子，，，，vroom，，，，XML2，，，，Yaml |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | https://github.com/yulab-smu/treeio(Devel）https://docs.ropensci.org/treeio/(Docs）https://yulab-smu.top/treedata-book/(Book）https://doi.org/10.1093/molbev/msz240(Paper） |
| BugReports | https://github.com/yulab-smu/treeio/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | 格特里，，，，微生物剂量，，，，树木化的特殊性 |
| 建议我 | 富集，，，，GGTREEEXTRA，，，，rfarm |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | treeio_1.20.0.tar.gz |
| Windows二进制 | treeio_1.20.0.zip |
| MacOS 10.13（高山脉） | treeio_1.20.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/treeio |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/treeio |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/treeio/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
