石棉水泥板

DOI:10.18129 / B9.bioc.transite

rna结合蛋白基序分析

Bioconductor版本:Release (3.15)

transite是一种计算方法，通过利用现有的基因表达数据和rna结合蛋白结合偏好的现有知识，可以全面分析rna结合蛋白在各种细胞过程中的调节作用。

作者:康斯坦丁·克里斯默[aut, cre, cph]，安娜·加廷格[au]，迈克尔·亚菲[ths, cph]——伊恩·坎内尔

维护者:Konstantin Krismer < Krismer at mit.edu>

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“石棉水泥板”)

超文本标记语言	R脚本	频谱Motif分析(SPMA)
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文本		许可证

细节

biocViews	bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载
版本	1.14.0
在Bioconductor	BioC 3.8 (R-3.5)(3.5年)
许可证	MIT +文件许可证
取决于	R (>= 3.5)
进口	BiocGenerics(> = 0.26.0),Biostrings(> = 2.48.0),dplyr(> = 0.7.6),GenomicRanges(> = 1.32.6),ggplot2(> = 3.0.0),ggseqlogo(>= 0.1)，gridExtra(>= 2.3)，方法，并行，Rcpp(> = 1.0.4.8),尺度(>= 1.0.0)， stats，TFMPvalue(>= 0.0.8)， utils
链接	Rcpp(> = 1.0.4.8)
建议	knitr(> = 1.20),rmarkdown(> = 1.10),roxygen2(> = 6.1.0),testthat(> = 2.1.0的)
SystemRequirements	c++ 11
增强了
URL	https://transite.mit.edu
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	transite_1.14.0.tar.gz
Windows二进制	transite_1.14.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	transite_1.14.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/transite
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/transite
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/transite/
软件包下载报告	下载数据