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tracktables
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DOI:10.18129 / B9.bioc.tracktables
构建IGV跟踪和HTML报告
Bioconductor版本:发行版(3.13)
在HTML页面中创建复杂IGV基因组浏览器会话和动态IGV报告的方法。
作者:Tom Carroll, Sanjay Khadayate, Anne Pajon，梁紫薇
维护者:Tom Carroll
引文(从R内，输入引用(“tracktables”))：
安装
要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("tracktables")
对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“tracktables”)
| R脚本 | 创建带有跟踪表的IGV HTML报告 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.26.0 |
| 在Bioconductor | BioC 3.0 (R-3.1)(6.5年) |
| 许可证 | GPL (>= 3) |
| 取决于 | R (>= 3.0.0) |
| 进口 | IRanges，GenomicRanges，XVector，Rsamtools，XML，tractor.base，stringr，RColorBrewer、方法 |
| 链接 | |
| 建议 | knitr，BiocStyle |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 全靠我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | tracktables_1.26.0.tar.gz |
| Windows二进制 | tracktables_1.26.0.zip(32位和64位) |
| macOS 10.13 (High Sierra) | tracktables_1.26.0.tgz |
| 源库 | Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/tracktables |
| 源存储库(开发人员访问) | Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/tracktables |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/tracktables/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
