TopDownr
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doi：10.18129/b9.bioc.topdownr
自上而下蛋白质组学中的破碎条件的研究
生物导体版本：版本（3.15）
TopDownr软件包允许自动研究碎片条件。它创建热轨道融合灯液方法文件来测试数百个碎片条件。此外，它提供了分析和处理生成的MS数据的功能，并确定最大化整体碎片覆盖的最佳条件。
作者：Sebastian Gibb [AUT，CRE]
，Pavel Shliaha [aut]，OleNørregaardJensen [aut]
维护者：塞巴斯蒂安·吉布（Sebastian Gibb）
引用（从r内，输入引用（“ topdownr”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：
if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）Biocmanager :: install（“ topdownr”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
browsevignettes（“ topdownr”）
| html | R脚本 | topDownr的数据生成 |
| html | R脚本 | topdownr的分裂分析 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.18.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.6（R-3.4）（4。5年） |
| 执照 | GPL（> = 3） |
| 要看 | R（> = 3.5），方法，生物基因（> = 0.20.0），蛋白质（> = 1.10.0），生物弦（> = 2.42.1），S4VECTORS（> = 0.12.2） |
| 进口 | grdevices，统计，工具，utils，生物酶，，，，矩阵（> = 1.2.10），MSNBase（> = 2.3.10），GGPLOT2（> = 2.2.1），MZR（> = 2.27.5） |
| 链接 | |
| 建议 | TopDownrdata（> = 0.2），尼特，，，，rmarkDown，，，，游侠，，，，测试，，，，生物使用，，，，XML2 |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | https://github.com/sgibb/topdownr/ |
| BugReports | https://github.com/sgibb/topdownr/issues/ |
| 取决于我 | TopDownrdata |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | topdownr_1.18.0.tar.gz |
| Windows二进制 | topdownr_1.18.0.zip |
| MacOS 10.13（高山脉） | topdownr_1.18.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/topdownr |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/topdownr |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/topdownr/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
