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tomoseqr
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DOI:10.18129 / B9.bioc.tomoseqr
为分析Tomo-seq数据R包
Bioconductor版本:版本(3.16)
“tomoseqr”是一个R包分析Tomo-seq数据。Tomo-seq是一个全基因组RNA断层扫描相结合的方法结合高通量RNA转录组测序和cryosectioning空间解决。“tomoseqr”从tomo-seq数据重建三维表达模式和可视化重建3 d的表达模式。
作者:Ryosuke Matsuzawa (aut (cre)
维护人员:Ryosuke Matsuzawa < kinakomochi。在gmail.com工作>
从内部引用(R,回车引用(“tomoseqr”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“tomoseqr”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“tomoseqr”)
| HTML | R脚本 | tomoseqr |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 | |
| 文本 | 许可证 |
细节
| biocViews | bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.2.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.15 (r - 4.2)(0.5年) |
| 许可证 | 麻省理工学院+文件许可证 |
| 取决于 | R (> = 4.2) |
| 进口 | grDevices、图形动画,宠物猫,dplyr,stringr,purrr、方法、闪亮的,BiocFileCache,readr、工具、情节,ggplot2 |
| 链接 | |
| 建议 | rmarkdown,knitr,BiocStyle,testthat(> = 3.0.0) |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | tomoseqr_1.2.0.tar.gz |
| Windows二进制 | tomoseqr_1.2.0.zip |
| macOS二进制(x86_64) | tomoseqr_1.2.0.tgz |
| macOS二进制(arm64) | tomoseqr_1.2.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/tomoseqr |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ tomoseqr |
| Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/tomoseqr/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/tomoseqr/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
