码头
 |
 |
 |
 |
 |
 |
 |
doi：10.18129/b9.bioc.tomoda
Tomo-Seq数据分析
生物导体版本：版本（3.15）
该软件包提供了许多易于使用的方法来分析和可视化tomo-seq数据。TOMO-SEQ技术基于组织的冷冻和连续切片的RNA-Seq。（参考：Kruse F，Junker JP，Van Oudenaarden A，Bakkers J. Tomo-Seq：一种以空间分辨率获得全基因组表达数据的方法。方法CellBiol。2016; 135：299-307。doi：10.1016/bs/bs。可以使用几个可见功能来创建易于修改的图。
作者：Wendao Liu [AUT，CRE]
维护者：wendao liu
引用（从r内，输入引用（“番茄”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：
if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）Biocmanager :: install（“ tomoda”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
Browsevignettes（“ Tomoda”）
| html | R脚本 | 码头 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 | |
| 文本 | 执照 |
细节
| 生物浏览 | bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.6.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.12（R-4.0）（1。5年） |
| 执照 | 麻省理工学院 +文件执照 |
| 要看 | R（> = 4.0.0） |
| 进口 | 方法，统计，grdevices，RESHAPE2，，，，RTSNE，，，，UMAP，，，，rcolorbrewer，，，，GGPLOT2，，，，Ggrepel，，，，总结性特征 |
| 链接 | |
| 建议 | 尼特，，，，rmarkDown，，，，生物使用，，，，测试 |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | https://github.com/liuwd15/tomoda |
| BugReports | https://github.com/liuwd15/tomoda/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | tomoda_1.6.0.tar.gz |
| Windows二进制 | tomoda_1.6.0.zip |
| MacOS 10.13（高山脉） | tomoda_1.6.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/tomoda |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：包装/汤匙 |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/tomoda/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
