timeOmics

DOI:10.18129 / B9.bioc.timeOmics

时间进程Multi-Omics数据集成

Bioconductor版本:版本(3.17)

timeOmics是一个通用的数据驱动框架集成multi-Omics纵向数据以相同的生物样本,选择关键的时间特性,并有很强的关联在同一个样本组。timeOmics的主要步骤是:1。休息平台和有时限的规范化和过滤步骤;2。每个生物造型成一个表达谱;3所示。随着时间的推移集群特性相同的表达谱;4所示。因果验证步骤。

作者:安东尼Bodein (aut (cre),奥利弗Chapleur (aut) Kim-Anh Le曹(aut) Arnaud所有权(aut)

维护人员:安东尼Bodein < antoine.bodein。1在ulaval.ca >

安装

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如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“timeOmics”)

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文档

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HTML	R脚本	timeOmics
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版本	1.12.0
Bioconductor自	BioC 3.11 (r - 4.0)(3年)
许可证	GPL-3
取决于	mixOmicsR (> = 4.0)
进口	dplyr tidyr,宠物猫,purrr、magrittr ggplot2, stringr, ggrepel,航空航天,plyr
链接
建议	BiocStyle雪,rmarkdown knitr testthat, tidyverse, igraph gplots
SystemRequirements
增强了
URL
BugReports	https://github.com/abodein/timeOmics/issues
取决于我
进口我
建议我	netOmics
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包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	timeOmics_1.12.0.tar.gz
Windows二进制	timeOmics_1.12.0.zip
macOS二进制(x86_64)	timeOmics_1.12.0.tgz
macOS二进制(arm64)	timeOmics_1.12.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/timeOmics
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ timeOmics
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/timeOmics/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/timeOmics/
包下载报告	下载数据