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tigre
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DOI:10.18129 / B9.bioc.tigre
表达重建的高斯过程转录因子推断
Bioconductor版本:发行版(3.15)
tigre包实现了我们的高斯过程微分方程模型方法，用于从单输入基序网络分析基因表达时间序列。该包可用于从已知靶基因的表达测量中推断未观察到的转录因子(TF)蛋白浓度，或用于对TF的候选靶点进行排序。
作者:Antti Honkela, Pei Gao, Jonatan Ropponen, Miika-Petteri Matikainen, Magnus Rattray, Neil D. Lawrence
维护者:Antti Honkela < Antti。Honkela在赫尔辛基。fi>
引用(从R中，输入引用(“tigre”))：
安装
要安装此包，启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("tigre")
对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:
browseVignettes(“tigre”)
| R脚本 | tigre用户指南 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.50.0 |
| 在Bioconductor公司 | BioC 2.6 (R-2.11)(12.5年) |
| 许可证 | AGPL-3 |
| 取决于 | R (>= 2.11.0)，BiocGenerics，Biobase |
| 进口 | 方法,AnnotationDbi，gplots，图形，grDevices, stats, utils，注释，DBI，RSQLite |
| 链接 | |
| 建议 | drosgenome1.db，彪马，光民，BiocStyle，BiocManager |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | https://github.com/ahonkela/tigre |
| BugReports | https://github.com/ahonkela/tigre/issues |
| 全靠我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 给我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。
| 源包 | tigre_1.50.0.tar.gz |
| Windows二进制 | tigre_1.50.0.zip |
| macOS 10.13 (High Sierra) | tigre_1.50.0.tgz |
| 源库 | Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/tigre |
| 源存储库(开发人员访问) | Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/tigre |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/tigre/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
