tidySingleCellExperiment

DOI:10.18129 / B9.bioc.tidySingleCellExperiment

带来SingleCellExperiment Tidyverse

Bioconductor版本:版本(3.15)

tidySingleCellExperiment是一个抽象的适配器的SingleCellExperiment容器形式的宠物猫,并允许数据操纵,策划和嵌套使用“tidyverse”。

作者:斯特凡诺Mangiola (aut (cre)

维护人员:斯特凡诺Mangiola < mangiolastefano gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“tidySingleCellExperiment”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“tidySingleCellExperiment”)

HTML	R脚本	tidySingleCellExperiment包的概述
PDF		参考手册

细节

biocViews	bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载
版本	1.6.3
Bioconductor自	BioC 3.12 (r - 4.0)(2年)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 4.0.0),ttservice,SingleCellExperiment
进口	SummarizedExperiment,dplyr,宠物猫,tidyr,ggplot2,情节,magrittr,rlang,purrr,生命周期、方法、跑龙套S4Vectors,tidyselect,省略,vctrs,支柱,stringr,cli,fansi
链接
建议	BiocStyle,testthat,knitr,减价,SingleCellSignalR,单,嘘,食物,tidyHeatmap,igraph,GGally,矩阵,uwot,celldex,dittoSeq,EnsDb.Hsapiens.v86
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/stemangiola/tidySingleCellExperiment
BugReports	https://github.com/stemangiola/tidySingleCellExperiment/issues
取决于我
进口我
建议我	sccomp
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	tidySingleCellExperiment_1.6.3.tar.gz
Windows二进制	tidySingleCellExperiment_1.6.3.zip
macOS 10.13(高山脉)	tidySingleCellExperiment_1.6.3.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/tidySingleCellExperiment
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ tidySingleCellExperiment
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/tidySingleCellExperiment/
包下载报告	下载数据
老BioC 3.15源码包	源存档