terraTCGAdata

DOI:10.18129 / B9.bioc.terraTCGAdata

在Terra MultiAssayExperiment OpenAccess TCGA数据

Bioconductor版本:版本(3.16)

利用现有的开放存取TCGA Terra, Bioconductor完善基础设施数据。利用地球的数据模型而不学它的复杂性。有几个功能,你可以复制/下载并生成一个MultiAssayExperiment TCGA的工作区Terra所提供的示例。

作者:马塞尔•拉莫斯(aut (cre)

维护人员:马塞尔·拉莫斯<烫发。在roswellpark.org ramosperez >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“terraTCGAdata”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“terraTCGAdata”)

HTML	R脚本	获得TCGA Terra MultiAssayExperiment数据
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载
版本	1.2.0
Bioconductor自	BioC 3.15 (r - 4.2)(0.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 4.2.0),铁砧,MultiAssayExperiment
进口	BiocFileCache,dplyr,GenomicRanges、方法、RaggedExperiment,readr,S4Vectors统计数据,tidyr,TCGAutils,跑龙套
链接
建议	knitr,rmarkdown,BiocStyle,withr,testthat(> = 3.0.0)
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/waldronlab/terraTCGAdata
BugReports	https://github.com/waldronlab/terraTCGAdata/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	terraTCGAdata_1.2.0.tar.gz
Windows二进制	terraTCGAdata_1.2.0.zip(64位)
macOS二进制(x86_64)	terraTCGAdata_1.2.0.tgz
macOS二进制(arm64)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/terraTCGAdata
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ terraTCGAdata
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/terraTCGAdata/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/terraTCGAdata/
包下载报告	下载数据