目标

DOI:10.18129 / B9.bioc.target

预测转录因子的组合功能

Bioconductor版本:Release (3.15)

实现从dna结合和微扰表达数据推断直接靶基因的BETA算法Wang et al. (2013) .将该算法扩展到从可压缩的结合和表达数据中预测两个dna结合元素的组合功能。

作者:Mahmoud Ahmed [aut, cre]

维护者:Mahmoud Ahmed < Mahmoud .s.;Fahmy在students.kasralainy.edu.eg>

引文(从R内,输入引用(“目标”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“目标”)

超文本标记语言 R脚本 使用目标预测组合绑定
超文本标记语言 R脚本 使用目标包
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

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版本 1.10.0
在Bioconductor BioC 3.10 (R-3.6)(2.5年)
许可证 GPL-3
取决于 R (>= 3.6)
进口 BiocGenericsGenomicRangesIRangesmatrixStats,方法,统计,图形,闪亮的
链接
建议 testthat(> =魅惑,knitrrmarkdownshinytestshinyBScovr
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/MahShaaban/target
BugReports https://github.com/MahShaaban/target/issues
全靠我
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包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 target_1.10.0.tar.gz
Windows二进制 target_1.10.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra) target_1.10.0.tgz
源库 Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/target
源存储库(开发人员访问) Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/target
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/target/
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