Bioconductor版本:版本(3.17)
为策划提供功能分割(或隐式的)网络(拔起,无向)和明确的网络(扎根、导演)和网状扩展。“ggtree”和使用功能从“模仿”和“phangorn”。它扩展了“ggtree”包(@Yu2017)允许系统网络的可视化使用“ggplot2”语法。它提供了另一种阴谋的功能已经在“猿”-和Schliep (2019)
作者:克劳斯Schliep (aut (cre),玛塔Vidal-Garcia (aut),克劳迪娅Solis-Lemus (aut)
,Leann Biancani (aut) Eren Ada (aut), l·弗朗西斯科Henao迪亚兹(aut) Guangchuang Yu(施)
维护人员:克劳斯Schliep <克劳斯。在gmail.com schliep >
从内部引用(R,回车引用(“tanggle”)
):
安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“tanggle”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“tanggle”)
HTML | R脚本 | * * * * * * tanggle: Visualizacion de红色filogeneticas反对* ggplot2 * |
HTML | R脚本 | * * * * * * tanggle:可视化的系统网络* ggplot2 *框架 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 |
版本 | 1.6.0 |
Bioconductor自 | BioC 3.14 (r - 4.1)(1.5年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R (> = 4.1), ggplot2 (> = 2.2.0),ggtree |
进口 | 猿(> = 5.0),phangorn(> = 2.5),跑龙套,方法 |
链接 | |
建议 | tinytest,BiocStyle,knitr ggimage rmarkdown |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://klausvigo.github.io/tangglehttps://github.com/KlausVigo/tanggle |
BugReports | https://github.com/KlausVigo/tanggle/issues |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
源包 | tanggle_1.6.0.tar.gz |
Windows二进制 | tanggle_1.6.0.zip(64位) |
macOS二进制(x86_64) | tanggle_1.6.0.tgz |
macOS二进制(arm64) | tanggle_1.6.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/tanggle |
源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ tanggle |
Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/tanggle/ |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/tanggle/ |
包下载报告 | 下载数据 |