翻译

doi：10.18129/b9.bioc.translatome

多个基因表达之间的比较

生物导体版本：版本（3.15）

在不同水平的基因表达（转录组，翻译组，蛋白质组）之间比较两种生物条件（治疗，未经治疗的患病与正常，突变体与野生型）的差异表达基因（DEG），使用几个统计方法：等级产品，翻译效率，t检验，Limma，Anota，Deseq，Edger。使用散点图，直方图，MA图，标准偏差（SD）图，变异系数（CV）图绘制结果的可能性。在先前针对两个表达水平的DEG列表中检测明显富集后的转录后调节因子（RBP，miRNA等）和基因本体术语。GO术语的比较仅在其中一个级别或两者中丰富。来自两个表达式水平的丰富GO术语列表之间的语义相似性得分的计算。视觉检查和比较富集的术语与热图，雷达图和小花。

作者：Toma Tebaldi，Erik Dassi，Galena Kostoska

维护者：toma tebaldi ，erik dassi

安装

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if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）Biocmanager :: install（“ Translatome”）

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文档

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细节

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版本	1.34.0
在生物导体中	Bioc 2.13（R-3.0）（9年）
执照	GPL-3
要看	R（> = 2.15.0），方法，林玛，，，，Sigpathway，，，，Anota，，，，deseq2，，，，EDGER，，，，rankprod，，，，topgo，，，，org.hs.eg.db，，，，Gosemsim，，，，热倍，，，，GPLOTS，，，，plotrix，，，，生物酶
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源包	Translatome_1.34.0.tar.gz
Windows二进制	Translatome_1.34.0.zip（仅64位）
MacOS 10.13（高山脉）	Translatome_1.34.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/translatome
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/translatome
包装短URL	//www.anjoumacpherson.com/packages/translatome/
软件包下载报告	下载统计