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tRNAscanImport
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DOI:10.18129 / B9.bioc.tRNAscanImport
导入tRNAscan-SE结果文件作为GRanges对象
生物导体版本:发布(3.13)
该包作为GRanges对象导入tRNAscan-SE的结果。
作者:Felix gm . Ernst
维护者:Felix gm Ernst < Felix .gm。恩斯特在outlook.com >
引文(从R中输入引用(“tRNAscanImport”)):
安装
要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:
如果(!require ("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
有关较旧版本的R，请参阅适当的Bioconductor释放。
文档
要查看系统中安装的软件包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“tRNAscanImport”)
| 超文本标记语言 | R脚本 | tRNAscanImport |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 | |
| 文本 | 许可证 |
细节
| biocViews | bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.12.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.7 (R-3.5)(3年) |
| 许可证 | GPL-3 +文件许可证 |
| 取决于 | R (> = 3.5),GenomicRanges,tRNA |
| 进口 | 方法,stringr,BiocGenerics,Biostrings,Structstrings,S4Vectors,IRanges,XVector,GenomeInfoDb,rtracklayer,BSgenome,Rsamtools |
| 链接 | |
| 建议 | BiocStyle,knitr,rmarkdown,testthat,ggplot2,BSgenome.Scerevisiae.UCSC.sacCer3 |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | https://github.com/FelixErnst/tRNAscanImport |
| BugReports | https://github.com/FelixErnst/tRNAscanImport/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | Structstrings,tRNA |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。
| 源包 | tRNAscanImport_1.12.0.tar.gz |
| Windows二进制 | tRNAscanImport_1.12.0.zip |
| macOS 10.13 (High Sierra) | tRNAscanImport_1.12.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/tRNAscanImport |
| 源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ tRNAscanImport |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/tRNAscanImport/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
