synlet

DOI:10.18129 / B9.bioc.synlet

合成致命RNAi筛选数据的命中选择

Bioconductor版本:发行版(3.16)

从合成致命RNAi屏幕数据中选择命中。例如，有两个相同的细胞系，除了一个基因在一个细胞系中被敲除。他们的兴趣是寻找那些在被siRNA进一步敲除后导致更强致死效应的基因。实施质量控制和各种可视化工具。四种不同的算法可以用来提取有趣的结果。该套件是基于384井板设计的，但在配置适当的情况下，也可适用于其他平台。

作者:邵春轩

维护人员:邵春轩

安装

要安装此包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("synlet")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“synlet”)

超文本标记语言	R脚本	synlet的一个工作演示
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细节

biocViews	bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载
版本	1.28.0
在Bioconductor公司	BioC 3.2 (R-3.2)(7年)
许可证	GPL-3
取决于	R (>= 3.2.0)，ggplot2
进口	杜比环绕声系统，dplyr、网格magrittr，RColorBrewer，RankProd，reshape2
链接
建议	knitr，testthat，rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
给我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

源包	synlet_1.28.0.tar.gz
Windows二进制	synlet_1.28.0.zip(64位)
macOS二进制文件(x86_64)	synlet_1.28.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)	synlet_1.28.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/synlet
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/synlet
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/synlet/
软件包下载报告	下载数据