经验丰富的人

DOI:10.18129 / B9.bioc.stageR

演员:级间的高通量基因表达数据分析R

Bioconductor版本:版本(3.15)

经验丰富的人包允许自动化级间高通量基因表达数据的分析。该方法在https://genomebiology.biomedcentral.com/articles/10.1186/s13059发表在《基因组生物学- 017 - 1277 - 0

作者:柯恩Van den Berge和列文克莱门特

维修工:柯恩Van den Berge <柯恩。在gmail.com vdberge >

从内部引用(R,回车引用(“经验丰富的人”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“经验丰富的人”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes(“经验丰富的人”)

HTML R脚本 演员:R级间高通量基因表达数据的分析
PDF 参考手册

细节

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版本 1.18.0
Bioconductor自 BioC 3.6 (r - 3.4)(5年)
许可证 GNU通用公共授权版本3
取决于 R (> = 3.4),SummarizedExperiment
进口 方法,统计数据
链接
建议 knitr,rmarkdown,BiocStyle、方法、Biobase,刨边机,limma,DEXSeq,testthat
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我 rnaseqDTU
进口我
建议我 MethReg,土星
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 stageR_1.18.0.tar.gz
Windows二进制 stageR_1.18.0.zip
macOS 10.13(高山脉) stageR_1.18.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/stageR
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/经验丰富的人
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/stageR/
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