- 家
- Bioconductor 3.15
- 软件包
- spqn
spqn
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DOI:10.18129 / B9.bioc.spqn
空间分位数正常化
Bioconductor版本:版本(3.15)
spqn包实现空间分位数正常化(spqn)。这个方法是删除一个开发相关关系从基因表达数据相关矩阵的建立。它可以作为预处理步骤之前co-expression分析。
作者:易王(cre, aut], Kasper丹尼尔·汉森(aut)
维修工:易王< yiwangthu5 gmail.com >
从内部引用(R,回车引用(“spqn”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“spqn”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“spqn”)
| HTML | R脚本 | spqn用户指南 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.8.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.11 (r - 4.0)(2.5年) |
| 许可证 | 艺术- 2.0 |
| 取决于 | R (> = 4.0),ggplot2,ggridges,SummarizedExperiment,BiocGenerics |
| 进口 | 图形、统计、跑龙套,matrixStats |
| 链接 | |
| 建议 | BiocStyle,knitr,rmarkdown、工具、spqnData(> = 0.99.3),RUnit |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | https://github.com/hansenlab/spqn |
| BugReports | https://github.com/hansenlab/spqn/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | spqn_1.8.0.tar.gz |
| Windows二进制 | spqn_1.8.0.zip |
| macOS 10.13(高山脉) | spqn_1.8.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/spqn |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ spqn |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/spqn/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
