Bioconductor版本:Release (3.15)
该软件包提供了基因表达时间过程数据的差异基因表达分析功能。采用自然三次样条回归模型。鉴定出的基因可进一步用于通路富集分析和/或时间依赖性基因调控关联网络的重建。
作者:Agata Michna
维护者:Herbert Braselmann
引文(从R内,输入引用(“splineTimeR”)
):
要安装这个包,启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“splineTimeR”)
R脚本 | splineTimeR | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 |
版本 | 1.24.0 |
在Bioconductor | BioC 3.3 (R-3.3)(6年) |
许可证 | GPL-3 |
取决于 | R (>= 3.3),Biobase,igraph,limma,GSEABase,gtools样条函数,GeneNet(> = 1.2.13),纵向(> = 1.1.12),金融中间人 |
进口 | |
链接 | |
建议 | knitr |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | splineTimeR_1.24.0.tar.gz |
Windows二进制 | splineTimeR_1.24.0.zip |
macOS 10.13 (High Sierra) | splineTimeR_1.24.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/splineTimeR |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/splineTimeR |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/splineTimeR/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |