splineTimeR

DOI:10.18129 / B9.bioc.splineTimeR

利用样条回归模型对基因表达数据进行时程差异分析,然后进行基因关联网络重建

Bioconductor版本:Release (3.15)

该软件包提供了基因表达时间过程数据的差异基因表达分析功能。采用自然三次样条回归模型。鉴定出的基因可进一步用于通路富集分析和/或时间依赖性基因调控关联网络的重建。

作者:Agata Michna

维护者:Herbert Braselmann , Martin Selmansberger < Martin。Selmansberger在helmholtz-muenchen.de>

引文(从R内,输入引用(“splineTimeR”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“splineTimeR”)

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版本 1.24.0
在Bioconductor BioC 3.3 (R-3.3)(6年)
许可证 GPL-3
取决于 R (>= 3.3),BiobaseigraphlimmaGSEABasegtools样条函数,GeneNet(> = 1.2.13),纵向(> = 1.1.12),金融中间人
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包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 splineTimeR_1.24.0.tar.gz
Windows二进制 splineTimeR_1.24.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra) splineTimeR_1.24.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/splineTimeR
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/splineTimeR
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/splineTimeR/
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