飞溅
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DOI:10.18129 / B9.bioc.splatter
单细胞RNA测序数据的简单模拟
生物导体版本:发布(3.12)
飞溅是一个软件包的模拟单细胞RNA测序计数数据。它提供了一个简单的界面，用于创建可复制且文档记录良好的复杂模拟。参数可以从真实数据中估计和功能提供了比较真实和模拟数据集。
作者:Luke Zappia
， Belinda Phipson [aut]， Christina AzodiAlicia Oshlack [aut]
维护者:Luke Zappia < Luke at lazappi.id.au>
引文(从R中输入引用(“飞溅”)):
安装
要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install(" splter ")
有关较旧版本的R，请参阅适当的Bioconductor释放。
文档
要查看系统中安装的软件包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“飞溅”)
| 超文本标记语言 | R脚本 | 介绍飞溅包 |
| 超文本标记语言 | R脚本 | 长条木板仿真参数 |
| 超文本标记语言 | R脚本 | splatPop模拟 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 | |
| 文本 | 许可证 |
细节
| biocViews | bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.14.1 |
| Bioconductor自 | BioC 3.5 (R-3.4)(4年) |
| 许可证 | GPL-3 +文件许可证 |
| 取决于 | R (> = 4.0),SingleCellExperiment |
| 进口 | BiocGenerics,BiocParallel,使彻底失败(> = 2.0.0),刨边机,fitdistrplus,ggplot2,locfit,matrixStats、方法、尺度,嘘(> = 1.15.16),统计数据,SummarizedExperiment跑龙套,蜡笔,S4Vectors, grDevices |
| 链接 | |
| 建议 | BiocStyle,covr,cowplot,魔法,knitr,limSolve,lme4,进步,pscl,testthat,preprocessCore,rmarkdown,scDD,食物,mfa,phenopath,基础知识(> = 1.7.10),zinbwave,SparseDC,BiocManager,拼写,igraph,天窗,BiocSingular,VariantAnnotation,Biostrings,GenomeInfoDb,GenomicRanges,IRanges |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | https://github.com/Oshlack/splatter |
| BugReports | https://github.com/Oshlack/splatter/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | NewWave,scPCA,SummarizedBenchmark |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。
| 源包 | splatter_1.14.1.tar.gz |
| Windows二进制 | splatter_1.14.1.zip |
| macOS 10.13 (High Sierra) | splatter_1.14.1.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/splatter |
| 源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/飞溅 |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/splatter/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
| BioC 3.12的旧源包 | 源存档 |
