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snpStats
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DOI:10.18129 / B9.bioc.snpStats
SnpMatrix和XSnpMatrix类和方法
Bioconductor版本:Release (3.15)
大型SNP关联研究的类和统计方法。这扩展了早期的snpMatrix包，允许基因型的不确定性。
作者:David Clayton
维护者:David Clayton
引文(从R内，输入引用(“snpStats”))：
安装
要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放。
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“snpStats”)
| R脚本 | 数据输入 | |
| R脚本 | 置 | |
| R脚本 | 归因和元分析 | |
| R脚本 | LD统计 | |
| R脚本 | 主成分分析 | |
| snpMatrix-differences | ||
| R脚本 | snpStats介绍 | |
| R脚本 | TDT)测试 | |
| 参考手册 |
细节
| biocViews | bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.46.0 |
| 在Bioconductor | BioC 2.8 (R-2.13)(11年) |
| 许可证 | GPL-3 |
| 取决于 | R (>= 2.10.0)，生存，矩阵、方法 |
| 进口 | 图形，grDevices，统计，utils，BiocGenerics，zlibbioc |
| 链接 | |
| 建议 | hexbin |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 全靠我 | MAGAR |
| 进口我 | DExMA，GeneGeneInteR，gwascat，ldblock，马提尼，旅游房车，scoreInvHap |
| 建议我 | crlmm，GenomicFiles，GWASTools，omicRexposome，omicsPrint，VariantAnnotation |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | snpStats_1.46.0.tar.gz |
| Windows二进制 | snpStats_1.46.0.zip |
| macOS 10.13 (High Sierra) | snpStats_1.46.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/snpStats |
| 源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/snpStats |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/snpStats/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
