snapcount.

DOI：10.18129 / b9.bioc.snapcount.

用于与Snaptron接口的R / Biocuconductor包，以便快速查询表达数

Bioconductor版本：释放（3.13）

SnapCount是一个客户端接口，用于Snaptron WebServices，其支持通过基因名称或基因组区域查询。结果包括从RNA-SEQ样品的对准和/或各种表达措施的原始表达计数在每种样品的一个或多个区域/基因上（例如含量的百分比）。

作者：Rone Charles [Aut，CRE]

维护者：Rone Charles

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“4.1”）并输入：

if（！percennamespace（“biocmanager”，静静= true））install.packages（“biocmanager”）biocmanager ::安装（“snapcount”）

对于旧版本，请参阅相应的生物导体释放。

文件

要查看系统中安装此包版本的文档，请启动r并输入：

Browsevignettes（“SnapCount”）

HTML.	r script.	SnapCount快速入门指南
PDF.		参考手册
文本		消息
文本		执照

细节

Biocviews.	bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载
版本	1.4.0.
在生物导体中以来	BIOC 3.11（R-4.0）（1年）
执照	mit +文件执照
依靠	r（> = 4.0.0）
进口	R6.那httr.那rlang.那邮风那雅思石那assertthat.那data.table.那矩阵那Magrittr.， 方法，stringr.，统计，绞喉那Genomicranges.那概括分析
链接到
建议	Biocmanager.那Bit64.那Covr.那kniTcitations.那kn（> = 1.6），devtools.那生物焦（> = 2.5.19），RAMAMAMDOW.（> = 0.9.5），testthat.（> = 2.1.0）
系统要求
加强
URL.	https://github.com/langmead-lab/snapcount.
Bugreports.	https://github.com/langmead-lab/snapcount/issues.
取决于我
进口我
建议我
链接给我
建立报告

包档案包

跟随bob 体育网址 在r会话中使用此包的说明。

源包	snapcount_1.4.0.tar.gz.
Windows二进制文件	snapcount_1.4.0.zip.
Macos 10.13（高塞拉）	snapcount_1.4.0.tgz.
源存储库	git clone https://git.biocumon.org/packages/snapcount.
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.biocondion.org：包/ snapcount
包短网址	https://biocumon.org/packages/snapcount/
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