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snapCGH
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DOI:10.18129 / B9.bioc.snapCGH
aCGH数据的分割,正常化和处理
Bioconductor版本:版本(3.16)
分段的方法,正常化和处理aCGH数据;包括绘图函数想象原始和单个和多个分段数据数组。
作者:迈克·l·史密斯,约翰·c·Marioni史蒂文·麦金尼托马斯•Hardcastle娜塔莉·p·索恩
维护人员:约翰Marioni < Marioni在ebi.ac.uk >
从内部引用(R,回车引用(“snapCGH”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“snapCGH”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“snapCGH”)
| R脚本 | 分割概述 | |
| 参考手册 |
细节
| biocViews | bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.68.0 |
| Bioconductor自 | BioC 1.8 (r - 2.3)(16.5年) |
| 许可证 | GPL |
| 取决于 | R (> = 3.5.0) |
| 进口 | aCGH,集群,DNAcopy,很高兴、图形、grDeviceslimma、方法、统计数据tilingArray,跑龙套 |
| 链接 | |
| 建议 | |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | ADaCGH2 |
| 建议我 | beadarraySNP |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | snapCGH_1.68.0.tar.gz |
| Windows二进制 | snapCGH_1.68.0.zip |
| macOS二进制(x86_64) | snapCGH_1.68.0.tgz |
| macOS二进制(arm64) | snapCGH_1.68.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/snapCGH |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ snapCGH |
| Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/snapCGH/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/snapCGH/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
