唱歌

doi:10.18129/b9.bioc.singscore

基于等级的单样本基因集评分方法

生物导体版本:版本(3.13)

一种简单的单样本基因签名评分方法,该方法使用基于等级的统计量来分析样本的基因表达谱。它在单样本水平上得分基因集的表达活性。

作者:Ruqian Lyu [AUT,CTB],Momeneh Foroutan [AUT,CTB],Dharmesh D. Bhuva [AUT,CRE]

维护者:Dharmesh D. Bhuva

引用(从r内,输入引用(“ singscore”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.1”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ singscore”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ singscore”)

html R脚本 单个样本评分
PDF 参考手册
文本 消息

细节

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版本 1.12.0
在生物导体中 Bioc 3.7(R-3.5)(3年)
执照 GPL-3
要看 R(> = 3.6)
进口 方法,统计,图形,GGPLOT2,grdevices,Ggrepel,,,,gseabase,,,,情节,,,,花花公子,,,,plyr,,,,马格里特,,,,重塑,,,,EDGER,,,,rcolorbrewer,,,,生物酶,,,,生物比较,,,,总结性特征,,,,矩阵,,,,RESHAPE2,,,,S4VECTORS
链接
建议 尼特,,,,rmarkDown,,,,测试
系统要求
增强
URL https://davislaboratory.github.io/singscore
BugReports https://github.com/davislaboratory/singscore/issues
取决于我
进口我 singscoreamlmutations,,,,tbsignatureprofiler
建议我 MSIGDB,,,,Visse
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 singscore_1.12.0.tar.gz
Windows二进制 singscore_1.12.0.zip(32-和64位)
MacOS 10.13(高山脉) singscore_1.12.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/singscore
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/singscore
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/singscore/
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