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DOI:10.18129 / B9.bioc.single
准确的共识序列从基因文库的纳米孔读取
Bioconductor版本:版本(3.16)
准确的共识序列从纳米孔读取DNA基因文库。单修正系统误差在纳米孔测序读基因库检索的共识序列变异用条形码标识,只需要几个读取/变体。在预印本doi的更多信息:https://doi.org/10.1101/2020.03.25.007146。
作者:Rocio埃斯帕达(aut (cre)
维护人员:Rocio埃斯帕达< rocio.espada在espci.fr >
从内部引用(R,回车引用(“单一”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(单)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes(“单一”)
| HTML | R脚本 | 单 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 许可证 |
细节
| biocViews | bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.2.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.15 (r - 4.2)(0.5年) |
| 许可证 | 麻省理工学院+文件许可证 |
| 取决于 | R (> = 4.1) |
| 进口 | Biostrings,BiocGenerics,dplyr,GenomicAlignments,IRanges、方法、reshape2,rlang,Rsamtools统计数据,stringr,tidyr,跑龙套 |
| 链接 | |
| 建议 | BiocStyle,knitr,rmarkdown |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | single_1.2.0.tar.gz |
| Windows二进制 | single_1.2.0.zip(64位) |
| macOS二进制(x86_64) | single_1.2.0.tgz |
| macOS二进制(arm64) | single_1.2.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/single |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/单 |
| Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/single/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/single/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
