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sigsquared
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DOI:10.18129 / B9.bioc.sigsquared
功能验证信号通路的基因签名生成
生物导体版本:发布(3.13)
通过利用二元阈值定义的患者队列的统计特性(生存的对数秩检验)，通过对成本函数进行优化，减少I型和II型错误，通过sigsquared包识别预后差的患者。
作者:UnJin李
维护人:UnJin Lee < UnJin at uchicago.edu>
引文(从R中输入引用(“sigsquared”)):
安装
要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:
如果(!安装BiocManager::install("sigsquared")
有关较旧版本的R，请参阅适当的Bioconductor释放。
文档
要查看系统中安装的软件包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“sigsquared”)
| R脚本 | SigSquared | |
| 参考手册 |
细节
| biocViews | bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.24.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.1 (R-3.2)(6年) |
| 许可证 | 3版GPL的 |
| 取决于 | R(>= 3.2.0)，方法 |
| 进口 | Biobase,生存 |
| 链接 | |
| 建议 | RUnit,BiocGenerics |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。
| 源包 | sigsquared_1.24.0.tar.gz |
| Windows二进制 | sigsquared_1.24.0.zip |
| macOS 10.13 (High Sierra) | sigsquared_1.24.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/sigsquared |
| 源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ sigsquared |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/sigsquared/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
