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siggenes
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DOI:10.18129 / B9.bioc.siggenes
使用SAM和Efron的经验贝叶斯方法进行多重测试
Bioconductor版本:Release (3.15)
利用微阵列显著性分析(SAM)和经验贝叶斯微阵列分析(EBAM)鉴定差异表达基因和估计错误发现率(FDR)。
作者:Holger Schwender
维护者:Holger Schwender < Holger。SCHW在gmx.de>
引文(从R内，输入引用(“siggenes”))：
安装
要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“siggenes”)
| 超文本标记语言 | identify.sam.html | |
| 超文本标记语言 | plot.ebam.html | |
| 超文本标记语言 | plot.finda0.html | |
| 超文本标记语言 | plot.sam.html | |
| 超文本标记语言 | print.ebam.html | |
| 超文本标记语言 | print.finda0.html | |
| 超文本标记语言 | print.sam.html | |
| R脚本 | siggenes手册 | |
| siggenesRnews.pdf | ||
| 超文本标记语言 | summary.ebam.html | |
| 超文本标记语言 | summary.sam.html | |
| 参考手册 |
细节
| biocViews | bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.70.0 |
| 在Bioconductor | BioC 1.6 (R-2.1)或更早(> 17年) |
| 许可证 | LGPL (>= 2) |
| 取决于 | Biobase，乘，样条，方法 |
| 进口 | stats4, grDevices，图形，统计，scrime(> = 1.2.5) |
| 链接 | |
| 建议 | affy，注释，genefilter，KernSmooth |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 全靠我 | KCsmart |
| 进口我 | coexnet，DeSousa2013，minfi，三人组，XDE |
| 建议我 | GCSscore，logicFS |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | siggenes_1.70.0.tar.gz |
| Windows二进制 | siggenes_1.70.0.zip |
| macOS 10.13 (High Sierra) | siggenes_1.70.0.tgz |
| 源库 | Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/siggenes |
| 源存储库(开发人员访问) | Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/siggenes |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/siggenes/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
