芝麻
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doi：10.18129/b9.bioc.sesame
DNA甲基化beadchips明智的逐步分析
生物导体版本：版本（3.13）
用于分析Illumina Infinium DNA甲基化阵列的工具。Sesame提供了公用事业，以支持多代Infinium DNA甲基化Beadchips的分析，包括预处理，质量控制，可视化和推理。芝麻具有更准确的检测呼叫，智能推断种族，性别和高级质量控制程序。
作者：徘徊周[AUT，CRE]，Hui Shen [AUT]，Timothy Triche [CTB]，Bret Barnes [CTB]
维护者：在gmail.com>
引用（从r内，输入引用（“芝麻”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.1”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ sesame”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
Browsevignettes（“芝麻”）
| html | R脚本 | 0.基本用法 |
| html | R脚本 | 1.质量控制 |
| html | R脚本 | 2.非人类阵列 |
| html | R脚本 | 3.建模 |
| html | R脚本 | 4.数据推断 |
| html | R脚本 | 5.其他功能 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 | |
| 文本 | 执照 |
细节
| 生物浏览 | bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.10.4 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.8（R-3.5）（2。5年） |
| 执照 | 麻省理工学院 +文件执照 |
| 要看 | r（> = 4.1），Sesamedata， 方法 |
| 进口 | 生物比较，grdevices，utils，Stringr，，，，蒂布尔，，，，Illuminaio，，，，大量的，，，，基因组机，，，，iranges， 网格，预处理，，，，S4VECTORS，，，，Randomforest，，，，小麦图，，，，GGPLOT2，，，，克恩斯门茶，图形，并行，矩阵，，，，DNACOPIGY，统计总结性特征 |
| 链接 | |
| 建议 | 秤，，，，尼特，，，，rmarkDown，，，，测试，，，，dplyr，，，，花花公子，，，，生物使用，，，，Illuminahumanmethylation450Kmanifest，，，，Minfi，，，，Flowsorted.cordbloodnorway.450k，，，，Flowsorted.blood.450k，，，，HDF5Array |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | https://github.com/zwdzwd/sesame |
| BugReports | https://github.com/zwdzwd/sesame/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | tcgabiolinksgui |
| 建议我 | 甲基，，，，rnbeads，，，，Sesamedata，，，，tcgabiolinks |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | sesame_1.10.4.4.tar.gz |
| Windows二进制 | sesame_1.10.4.4.zip |
| MacOS 10.13（高山脉） | sesame_1.10.4.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/sesame |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：包装/芝麻 |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/sesame/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
| Bioc 3.13的旧源软件包 | 来源存档 |
