seqsetvis
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doi：10.18129/b9.bioc.seqsetvis
基于设置的下一代测序数据的可视化
生物导体版本：版本（3.13）
SEQSETVIS可以在下一代测序数据中对基因组位点集的可视化和分析。尽管SEQSETVI是为了比较Mulitple芯片seq样品的比较，但该软件包是域 - 无义的，允许处理多个基因组坐标文件（床单式文件）和信号文件（BAM文件中的BigWig文件堆积）。
作者：Joseph R Boyd [AUT，CRE]
维护者：Joseph R Boyd
引用（从r内，输入引用（“ seqsetvis”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.1”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ seqsetvis”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
browsevignettes（“ seqsetvis”）
| html | R脚本 | 概述和用例 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 | |
| 文本 | 执照 |
细节
| 生物浏览 | bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.12.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.7（R-3.5）（3年） |
| 执照 | 麻省理工学院 +文件执照 |
| 要看 | r（> = 3.6），GGPLOT2 |
| 进口 | Data.Table，，，，欧拉，，，，GenomeInfodB，，，，基因组签名，，，，基因组机，，，，ggplotify，grdevices，网格，iranges，，，，林玛， 方法，pbapply，，，，pbmcapply，，，，PNG，，，，rcolorbrewer，，，，rsamtools，，，，rtracklayer，，，，S4VECTORS，统计insctr |
| 链接 | |
| 建议 | Biocfilecache，，，，生物管理器，，，，生物使用，，，，Chippeakanno，，，，COVR，，，，牛仔图，，，，尼特，，，，rmarkDown，，，，测试 |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | seqsetvis_1.12.0.tar.gz |
| Windows二进制 | seqsetvis_1.12.0.zip（32-和64位） |
| MacOS 10.13（高山脉） | seqsetvis_1.12.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/seqsetvis |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/seqsetvis |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/seqsetvis/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
