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seqTools
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DOI:10.18129 / B9.bioc.seqTools
分析核苷酸序列和质量内容fastq文件
Bioconductor版本:版本(3.13)
分析阅读长度,phr分数和字母频率和DNA k-mers未压缩和压缩fastq文件。
作者:沃尔夫冈·凯瑟
维护者:沃尔夫冈·凯瑟在med.uni-duesseldorf.de > <凯撒
从内部引用(R,回车引用(“seqTools”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:
如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“seqTools”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“seqTools”)
| R脚本 | 介绍 | |
| R脚本 | seqTools_qual_report | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.26.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.0 (r - 3.1)(6.5年) |
| 许可证 | 艺术- 2.0 |
| 取决于 | 方法,跑龙套,zlibbioc |
| 进口 | |
| 链接 | zlibbioc |
| 建议 | RUnit,BiocGenerics |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | qckitfastq |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | seqTools_1.26.0.tar.gz |
| Windows二进制 | seqTools_1.26.0.zip |
| macOS 10.13(高山脉) | seqTools_1.26.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/seqTools |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ seqTools |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/seqTools/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
