生物导体版本:版本(3.13)
Seqlogo采用DNA序列基序的位置权重矩阵,并绘制Schneider和Stephens(1990)引入的相应序列徽标。
作者:Oliver Bembom [Aut],Robert Ivanek [Aut,Cre]
维护者:Robert Ivanek
引用(从r内,输入引用(“ seqlogo”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.1”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ seqlogo”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“ seqlogo”)
html | R脚本 | DNA序列比对的序列徽标 |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 |
版本 | 1.58.0 |
在生物导体中 | Bioc 2.0(R-2.5)(14年) |
执照 | LGPL(> = 2) |
要看 | 方法,网格 |
进口 | Stats4,Grdevices |
链接 | |
建议 | 尼特,,,,生物使用,,,,rmarkDown,,,,测试 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
BugReports | https://github.com/ivanek/seqlogo/issues |
取决于我 | 结肠管制,,,,rgadem |
进口我 | IGVR,,,,兴趣,,,,pwmenrich,,,,rgadem,,,,riboseqr,,,,碎片,,,,TFBSTOOLS |
建议我 | Bcrank,,,,difflogo,,,,玛格尔,,,,主题,,,,主题,,,,Universalmotif |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | seqlogo_1.58.0.tar.gz |
Windows二进制 | seqlogo_1.58.0.zip |
MacOS 10.13(高山脉) | seqlogo_1.58.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/seqlogo |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/seqlogo |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/seqlogo/ |
软件包下载报告 | 下载统计 |