seqlogo

doi:10.18129/b9.bioc.seqlogo

DNA序列比对的序列徽标

生物导体版本:版本(3.13)

Seqlogo采用DNA序列基序的位置权重矩阵,并绘制Schneider和Stephens(1990)引入的相应序列徽标。

作者:Oliver Bembom [Aut],Robert Ivanek [Aut,Cre]

维护者:Robert Ivanek

引用(从r内,输入引用(“ seqlogo”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.1”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ seqlogo”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ seqlogo”)

html R脚本 DNA序列比对的序列徽标
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载
版本 1.58.0
在生物导体中 Bioc 2.0(R-2.5)(14年)
执照 LGPL(> = 2)
要看 方法,网格
进口 Stats4,Grdevices
链接
建议 尼特,,,,生物使用,,,,rmarkDown,,,,测试
系统要求
增强
URL
BugReports https://github.com/ivanek/seqlogo/issues
取决于我 结肠管制,,,,rgadem
进口我 IGVR,,,,兴趣,,,,pwmenrich,,,,rgadem,,,,riboseqr,,,,碎片,,,,TFBSTOOLS
建议我 Bcrank,,,,difflogo,,,,玛格尔,,,,主题,,,,主题,,,,Universalmotif
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 seqlogo_1.58.0.tar.gz
Windows二进制 seqlogo_1.58.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) seqlogo_1.58.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/seqlogo
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/seqlogo
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/seqlogo/
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