Bioconductor版本:发行版(3.16)
sechm在summarizeexperiment对象和ComplexHeatmap包之间提供了一个简单的接口。它支持从SE对象绘制带注释的热图,可以轻松访问rowData和colData列,并实现了许多特性,使热图的生成更容易、更灵活。这些功能曾经是SEtools包的一部分。
作者:Pierre-Luc Germain [cre, aut]
维护者:Pierre-Luc Germain < Pierre-Luc。日耳曼在hest.ethz.ch>
引文(从R内,输入引用(“sechm”)
):
要安装这个包,启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“sechm”)
超文本标记语言 | R脚本 | sechm |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 |
版本 | 1.6.0 |
在Bioconductor | BioC 3.13 (R-4.1)(1.5年) |
许可证 | GPL-3 |
取决于 | R (>= 4.0) |
进口 | S4Vectors,SummarizedExperiment,系列化,ComplexHeatmap,circlize、方法、randomcoloR,统计,网格,grDevices,matrixStats |
链接 | |
建议 | BiocStyle,knitr,rmarkdown |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
BugReports | https://github.com/plger/sechm |
全靠我 | SEtools |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | sechm_1.6.0.tar.gz |
Windows二进制 | sechm_1.6.0.zip |
macOS二进制文件(x86_64) | sechm_1.6.0.tgz |
macOS二进制文件(arm64) | sechm_1.6.0.tgz |
源库 | Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/sechm |
源存储库(开发人员访问) | Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/sechm |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/sechm/ |
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