sechm

DOI:10.18129 / B9.bioc.sechm

sechm:来自总结实验的复杂热图

Bioconductor版本:发行版(3.16)

sechm在summarizeexperiment对象和ComplexHeatmap包之间提供了一个简单的接口。它支持从SE对象绘制带注释的热图,可以轻松访问rowData和colData列,并实现了许多特性,使热图的生成更容易、更灵活。这些功能曾经是SEtools包的一部分。

作者:Pierre-Luc Germain [cre, aut]

维护者:Pierre-Luc Germain < Pierre-Luc。日耳曼在hest.ethz.ch>

引文(从R内,输入引用(“sechm”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“sechm”)

超文本标记语言 R脚本 sechm
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews bob 体育平台下载 bob 体育平台下载 bob 体育平台下载
版本 1.6.0
在Bioconductor BioC 3.13 (R-4.1)(1.5年)
许可证 GPL-3
取决于 R (>= 4.0)
进口 S4VectorsSummarizedExperiment系列化ComplexHeatmapcirclize、方法、randomcoloR,统计,网格,grDevices,matrixStats
链接
建议 BiocStyleknitrrmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL
BugReports https://github.com/plger/sechm
全靠我 SEtools
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 sechm_1.6.0.tar.gz
Windows二进制 sechm_1.6.0.zip
macOS二进制文件(x86_64) sechm_1.6.0.tgz
macOS二进制文件(arm64) sechm_1.6.0.tgz
源库 Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/sechm
源存储库(开发人员访问) Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/sechm
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/sechm/
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