天窗
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DOI:10.18129 / B9.bioc.scuttle
单细胞RNA-Seq分析工具
生物导体版本:发布(3.12)
为执行单细胞分析提供基本实用功能，专注于简单的标准化、质量控制和数据转换。还提供了一些辅助函数来帮助其他包的开发。
作者:Aaron Lun, Davis McCarthy [aut]
维护者:Aaron Lun
引文(从R中输入引用(“天窗”)):
安装
要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:
如果(!安装BiocManager::install(" sctle ")
有关较旧版本的R，请参阅适当的Bioconductor释放。
文档
要查看系统中安装的软件包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“天窗”)
| 超文本标记语言 | R脚本 | 方案概述 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.0.4 |
| Bioconductor自 | BioC 3.12 (R-4.0)(0.5年) |
| 许可证 | GPL-3 |
| 取决于 | SingleCellExperiment |
| 进口 | 方法,跑龙套,统计数据,矩阵,Rcpp,BiocGenerics,S4Vectors,BiocParallel,GenomicRanges,SummarizedExperiment,DelayedArray,DelayedMatrixStats,beachmat |
| 链接 | Rcpp,beachmat |
| 建议 | BiocStyle,knitr,scRNAseq,rmarkdown,testthat |
| SystemRequirements | c++ 11 |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | 后面;,DropletUtils,嘘,scDblFinder,食物,伶盗龙 |
| 建议我 | 咆哮,HCAData,单,一口,飞溅,TSCAN |
| 我的链接 | DropletUtils,食物 |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。
| 源包 | scuttle_1.0.4.tar.gz |
| Windows二进制 | scuttle_1.0.4.zip(32位和64位) |
| macOS 10.13 (High Sierra) | scuttle_1.0.4.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/scuttle |
| 源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/天窗 |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/scuttle/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
| BioC 3.12的旧源包 | 源存档 |
