用水晶球占卜

DOI:10.18129 / B9.bioc.scry

高维数据的小计数分析方法

Bioconductor版本:发布(3.15)

许多现代生物数据集由小计数组成，不能很好地用标准的线性-高斯方法(如主成分分析)拟合。这个包提供了基于计数的特征选择和降维算法的实现。这些方法可用于促进对任何高维数据(如单细胞RNA-seq)的无监督分析。

作者:Kelly Street [aut, cre]， F. William Townes [aut, cph]， Davide Risso [aut]， Stephanie Hicks [aut]

维修工:凯利街。Kelly在gmail.com>

安装

要安装这个包，启动R(版本"4.2")并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install(" script ")

对于旧版本的R，请参考相应的Bioconductor释放。

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，启动R并输入:

browseVignettes(“用水晶球占卜”)

超文本标记语言	R脚本	Scry方法概述
超文本标记语言	R脚本	大数据集的Scry方法
PDF		参考手册

细节

biocViews	bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载
版本	1.8.0
在Bioconductor中	BioC 3.11 (R-4.0)(2年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R(>= 4.0)，统计，方法
进口	DelayedArray，glmpca(> = 0.2.0),HDF5Array，矩阵，SingleCellExperiment，SummarizedExperiment，BiocSingular
链接
建议	减价，BiocGenerics，covr，DuoClustering2018，ggplot2，knitr，rmarkdown，TENxPBMCData，testthat
SystemRequirements
增强了
URL	//www.anjoumacpherson.com/packages/scry.html
BugReports	https://github.com/kstreet13/scry/issues
这取决于我
进口我
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在您的R会话中使用此包的说明。

源包	scry_1.8.0.tar.gz
Windows二进制	scry_1.8.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	scry_1.8.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/scry
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/scry
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/scry/
软件包下载报告	下载数据