得分invhap.

DOI:10.18129 / b9.bioc.scoreinvhap.

在预定义区域获取反转状态

Bioconductor版本:释放(3.13)

ScietInVhap可以获得已知逆变的样本的反转状态。ScietInVhap使用SNP数据作为输入,并且需要有关倒置的信息:在参考区域SNP和反转状态和杂合子基因型之间的不同单倍型中的基因型频率。该包包括21个enversions的此数据。

作者:Carlos Ruiz [Aut],DolorsPelegregrí[Aut],Juan R. Gonzalez [Aut,Cre]

维护者:Dolors Pelegri-Siso

引文(从R内,输入引文(“得分”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.1”)并输入:

if(!percennamespace(“biocmanager”,squilly = true))install.packages(“biocmanager”)biocmanager ::安装(“sceetInvhap”)

对于旧版本,请参阅相应的生物导体释放

文件

要查看系统中安装此包版本的文档,请启动r并输入:

BROWSEVIGNETTES(“SteetInvhap”)

HTML. r script. 与StreadVhap的反演基因分型
PDF. 参考手册
文本 执照

细节

Biocviews. bob 体育平台下载 bob 体育平台下载 bob 体育平台下载 bob 体育平台下载
版本 1.14.0
在生物导体中以来 BIOC 3.6(R-3.4)(3.5岁)
执照 文件执照
依靠 r(> = 3.6.0)
进口 生物仪器, 方法,Snpstats.VariantAnnotation.Genomicranges.生物相投,图形,概括分析
链接到
建议 testthat.kn生物焦RAMAMAMDOW.
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源包 scieteinvhap_1.14.0.tar.gz.
Windows二进制文件 scieteinvhap_1.14.0.zip.
Macos 10.13(高塞拉) scieteinvhap_1.14.0.tgz.
源存储库 git clone https://git.biocumon.org/packages/scoreinvhap.
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.biocondion.org:包/ sceeinvhap
包短网址 https://biocumon.org/packages/scoreinvhap/
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