司康饼

DOI:10.18129 / B9.bioc.scone

单细胞规范化表达数据概述

Bioconductor版本:发布(3.15)

SCONE是一个R软件包，用于比较和排名单细胞RNA-seq和其他高通量分析的不同归一化方案的性能。

作者:Michael Cole [aut, cph]， Davide Risso [aut, cre, cph]， Matteo Borella [ctb]， Chiara Romualdi [ctb]

维护者:Davide Risso < Risso。大卫在gmail.com>

安装

要安装这个包，启动R(版本"4.2")并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("scone")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放。

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“烤饼”)

超文本标记语言	R脚本	司康介绍
超文本标记语言	R脚本	PsiNorm正常化
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载
版本	1.20.0
在Bioconductor	BioC 3.5 (R-3.4)(5.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R(>= 3.4)，方法;SummarizedExperiment
进口	图形，统计，utils，aroma.light，BiocParallel，类，集群，作文，diptest，刨边机，fpc，gplotsgrDevices,hexbin，limma，matrixStats，mixtools，RColorBrewer，引导，rhdf5，RUVSeq，rARPACK，MatrixGenerics，SingleCellExperiment
链接
建议	BiocStyle，DT，ggplot2，knitr，miniUI，NMF，情节，reshape2，rmarkdown，食物，scRNAseq，闪亮的，testthat，visNetwork，doParallel，BatchJobs，飞溅，嘘，kableExtra，mclust，TENxPBMCData
SystemRequirements
增强了
URL
BugReports	https://github.com/YosefLab/scone/issues
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	scone_1.20.0.tar.gz
Windows二进制	scone_1.20.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	scone_1.20.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/scone
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/scone
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/scone/
软件包下载报告	下载数据