Scmeth
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doi：10.18129/b9.bioc.scmeth
在甲基化数据中进行质量控制分析的功能
生物导体版本：版本（3.15）
可以在此处找到分析甲基化数据的功能。某些功能与单细胞甲基化数据有关，但大多数其他功能都可以用于任何甲基化数据。该工作流程的亮点是综合质量控制报告。
作者：divy kangeyan
维护者：divy kangeyan
引用（从r内，输入引用（“ scmeth”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：
if（！quired（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ scmeth”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
Browsevignettes（“ Scmeth”）
| html | R脚本 | 小插图标题 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.16.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.7（R-3.5）（4年） |
| 执照 | GPL-2 |
| 要看 | R（> = 3.5.0） |
| 进口 | 尼特，，，，rmarkDown，，，，BSSEQ，，，，AnnotationHub，，，，基因组机，，，，RESHAPE2，统计，utils，BSGENOME，，，，延迟（> = 0.5.15），Annotatr，，，，总结性特征（> = 1.5.6），GenomeInfodB，，，，生物弦，，，，DT，，，，HDF5Array（> = 1.7.5） |
| 链接 | |
| 建议 | bsgenome.mmusculus.ucsc.mm10，，，，bsgenome.hsapiens.ncbi.grch38，，，，txdb.hsapiens.ucsc.hg38.nown，，，，org.hs.eg.db，，，，生物酶，，，，生物基因，，，，GGPLOT2，，，，ggthemes |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | |
| BugReports | https://github.com/aryeelab/scmeth/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | 饼干 |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | scmeth_1.16.0.tar.gz |
| Windows二进制 | scmeth_1.16.0.zip（仅64位） |
| MacOS 10.13（高山脉） | scmeth_1.16.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/scmeth |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/scmeth |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/scmeth/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
