Schex

doi:10.18129/b9.bioc.schex

单元格数据的Hexbin图

生物导体版本:版本(3.13)

构建用于变量的Hexbin图和存储在单元格数据中的尺寸降低,例如单细胞Perlexperiment和SeuratObject。该包装中使用的想法是基于Dan Carr,Nicholas Lewin-Koh,Martin Maechler和Thomas Lumley的出色工作。

作者:Saskia Freytag

维护者:saskia freytag

引用(从r内,输入引用(“ Schex”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.1”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ schex”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Schex”)

html R脚本 multi_modal_schex
html R脚本 选择_the_right_resolution
html R脚本 seurat_schex
html R脚本 Shiny_schhex
html R脚本 使用_schex
PDF 参考手册
文本 消息

细节

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版本 1.6.3
在生物导体中 Bioc 3.10(R-3.6)(1。5年)
执照 GPL-3
要看 Singlecellexperiment(> = 1.7.4),Seurat,,,,GGPLOT2(> = 3.2.1),闪亮的
进口 Hexbin,统计,方法,,,,,dplyr,,,,,,,,GGFORCE,,,,, 网格,凹者
链接
建议 Ggrepel,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,测试(> = 2.1.0),COVR,,,,tenxpbmcdata,,,,评分,,,,发光的dashboard,,,,我明白,,,,Igraph,,,,斯克兰
系统要求
增强
URL https://github.com/saskiafreytag/schex
BugReports https://github.com/saskiafreytag/schex/issues
取决于我
进口我 sctensor,,,,sctgif
建议我 FCOEX
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 schex_1.6.3.tar.gz
Windows二进制 schex_1.6.3.zip
MacOS 10.13(高山脉) schex_1.6.3.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/schex
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/schex
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/schex/
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