生物导体版本:版本(3.13)
构建用于变量的Hexbin图和存储在单元格数据中的尺寸降低,例如单细胞Perlexperiment和SeuratObject。该包装中使用的想法是基于Dan Carr,Nicholas Lewin-Koh,Martin Maechler和Thomas Lumley的出色工作。
作者:Saskia Freytag
维护者:saskia freytag
引用(从r内,输入引用(“ Schex”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.1”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ schex”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ Schex”)
html | R脚本 | multi_modal_schex |
html | R脚本 | 选择_the_right_resolution |
html | R脚本 | seurat_schex |
html | R脚本 | Shiny_schhex |
html | R脚本 | 使用_schex |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 |
版本 | 1.6.3 |
在生物导体中 | Bioc 3.10(R-3.6)(1。5年) |
执照 | GPL-3 |
要看 | Singlecellexperiment(> = 1.7.4),Seurat,,,,GGPLOT2(> = 3.2.1),闪亮的 |
进口 | Hexbin,统计,方法,簇,,,,dplyr,,,,熵,,,,GGFORCE,,,,秤, 网格,凹者 |
链接 | |
建议 | Ggrepel,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,测试(> = 2.1.0),COVR,,,,tenxpbmcdata,,,,评分,,,,发光的dashboard,,,,我明白,,,,Igraph,,,,斯克兰 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | https://github.com/saskiafreytag/schex |
BugReports | https://github.com/saskiafreytag/schex/issues |
取决于我 | |
进口我 | sctensor,,,,sctgif |
建议我 | FCOEX |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | schex_1.6.3.tar.gz |
Windows二进制 | schex_1.6.3.zip |
MacOS 10.13(高山脉) | schex_1.6.3.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/schex |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/schex |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/schex/ |
软件包下载报告 | 下载统计 |
Bioc 3.13的旧源软件包 | 来源存档 |