scTGIF

DOI:10.18129 / B9.bioc.scTGIF

未加注释的单细胞RNA-Seq数据的细胞类型注释

Bioconductor版本:发布(3.15)

scTGIF连接细胞和相关基因功能,不需要细胞类型标记。

作者:Tsuyuzaki [aut, re]

维护者:Tsuyuzaki

引用(来自R,输入引用(“scTGIF”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本"4.2")并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("scTGIF")

对于旧版本的R,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,启动R并输入:

browseVignettes(“scTGIF”)

超文本标记语言 R脚本 scTGIF
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细节

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版本 1.10.0
在Bioconductor中 BioC 3.10 (R-3.6)(3年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (>= 3.6.0)
进口 GSEABaseBiobaseSingleCellExperimentBiocStyle情节tagcloudrmarkdownRcpp设备、图形、实用程序、knitrS4VectorsSummarizedExperimentRColorBrewernnTensor、方法、尺度msigdbrschex宠物猫ggplot2igraph
链接
建议 testthat
SystemRequirements
增强了
URL
这取决于我
进口我
建议我 scTensor
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在您的R会话中使用此包的说明。

源包 scTGIF_1.10.0.tar.gz
Windows二进制 scTGIF_1.10.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra) scTGIF_1.10.0.tgz
源库 git clone https://git.bioconductor.org/packages/scTGIF
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/scTGIF
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/scTGIF/
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