scRecover

DOI:10.18129 / B9.bioc.scRecover

用于植入单细胞RNA-seq数据的屏幕盖

Bioconductor版本:Release (3.15)

scRecover是一个R包，用于输入单细胞RNA-seq (scRNA-seq)数据。它将在scRNA-seq原始读计数矩阵中检测和输入退出值，同时保持真实零不变，因为在scRNA-seq数据中同时存在退出零和真实零。通过与scImpute、SAVER和MAGIC的结合，scRecover不仅能以更高的精度检测掉零点和真实零点，还能改善下游聚类和可视化结果。

作者:苗准，张学功<张xg at tsinghua.edu.cn>

维护人员:准苗

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“scRecover”)

超文本标记语言	R脚本	scRecover
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细节

biocViews	bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载
版本	1.12.0
在Bioconductor	BioC 3.9 (R-3.6)(3.5年)
许可证	GPL
取决于	R (>= 3.4.0)
进口	统计，utils，方法，图形，doParallel，foreach平行,处罚，kernlab，rsvd，矩阵-14年(> = 1.2),质量-45年(> = 7.3),pscl(> = 1.4.9),bbmle(> = 1.0.18),gamlss(4.4 > = 0),preseqR(> = 4.0.0),储蓄者(>= 1.1.1)， Rmagic (>= 1.3.0)BiocParallel(> = 1.12.0)
链接
建议	knitr，rmarkdown，SingleCellExperiment，testthat
SystemRequirements
增强了
URL	https://miaozhun.github.io/scRecover
BugReports	https://github.com/miaozhun/scRecover/issues
全靠我
进口我
建议我
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	scRecover_1.12.0.tar.gz
Windows二进制	scRecover_1.12.0.zip(64位)
macOS二进制文件(x86_64)	scRecover_1.12.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/scRecover
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/scRecover
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/scRecover/
软件包下载报告	下载数据