scfeaturefilter

doi:10.18129/b9.bioc.scfeaturefilter

基于相关的单细胞RNASEQ数据质量过滤的方法

生物导体版本:版本(3.13)

JOSHI实验室开发的基于相关方法的R实现,用于分析和过滤处理的单细胞RNASEQ数据。它返回仅包含基因表达值的数据的过滤版本,而不受系统噪声影响。

作者:Angeles Arzalluz-Luque [aut],Guillaume Devailly [Aut,Cre],Anagha Joshi [aut]

维护者:guillaume devailly > gdevailly>

引用(从r内,输入引用(“ scfeaturefilter”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.1”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ scfeaturefilter”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ scfeaturefilter”)

html R脚本 ScfeatureFilter简介
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文本 消息
文本 执照

细节

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版本 1.12.0
在生物导体中 Bioc 3.7(R-3.5)(3年)
执照 麻省理工学院 +文件执照
要看 R(> = 3.6)
进口 dplyr(> = 0.7.3),GGPLOT2(> = 2.1.0),马格里特(> = 1.5),rlang(> = 0.1.2),蒂布尔(> = 1.3.4),统计,方法
链接
建议 测试,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,生物使用,,,,Singlecellexperiment,,,,总结性特征,,,,scrnaseq,,,,牛仔图
系统要求
增强
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取决于我
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构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 scfeaturefilter_1.12.0.tar.gz
Windows二进制 scfeaturefilter_1.12.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) scfeaturefilter_1.12.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/scfeaturefilter
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/scfeaturefilter
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/scfeaturefilter/
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