土星
 |
 |
 |
 |
 |
 |
 |
doi：10.18129/b9.bioc.saturn
对散装和单细胞RNA的应用应用的差分转录使用的可扩展分析
生物导体版本：版本（3.13）
土星提供了一个可笑的性能且可扩展的框架，用于执行差异转录用法分析。该软件包由三个主要功能组成。第一个函数FITDTU拟合了在不同感兴趣组中模拟转录本的准广义线性模型。第二个功能，TestDTU测试了感兴趣群体之间转录本的差异使用。最后，PlotDtu可视化感兴趣的群体中转录本的使用曲线。
作者：Jeroen Gilis [AUT，CRE]，Kristoffer Vitting-Seerup [CTB]，Koen van den Berge [CTB]，Lieven Clement [CTB]
维护者：jeroen gilis
引用（从r内，输入引用（“土星”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.1”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“土星”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
Browsevignettes（“土星”）
| html | R脚本 | 土星 - 小插图 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.0.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.13（R-4.1）（<6个月） |
| 执照 | 艺术2.0 |
| 要看 | R（> = 4.1） |
| 进口 | locfdr，，，，总结性特征，，，，生物比较，，，，林玛，，，，pbapply，，，，GGPLOT2，，，，引导，，，，矩阵，统计，方法，图形 |
| 链接 | |
| 建议 | 尼特，，，，rmarkDown，，，，测试，，，，COVR，，，，生物使用，，，，AnnotationHub，，，，Ensembldb，，，，EDGER，，，，dexseq，，，，斯塔格，，，，延迟 |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | https://github.com/statomics/saturn |
| BugReports | https://github.com/statomics/saturn/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | SATURN_1.0.0.TAR.GZ |
| Windows二进制 | SATURN_1.0.0.ZIP（32-和64位） |
| MacOS 10.13（高山脉） | SATURN_1.0.0.TGZ |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/saturn |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：包装/土星 |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/saturn/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
